澳門海關於2017年7月3日，在社交網站發現正流傳一張顯示外港客運碼頭上方國旗被倒轉懸掛的照片，海關在獲悉事件後已於當日即時派員處理及糾正。
保安司司長高度重視事件，指出澳門海關事後雖然已經做出相關指引並加強監督，但事件確實反映了該部門的監督工作存在問題，故已即時指示澳門海關必須將責任的履行落實到各級主管及人員當中，有錯必罰，職責相當。
同時，保安司司長亦已嚴肅要求其他部隊和部門以此為鑑，嚴格按照法律規定維護國旗和區旗的尊嚴，並確保一切執法工作依法進行，以持續提升部隊和部門的公共形象。
澳門海關十分關注事件，承認該事件屬人為疏忽，會嚴肅跟進處理，並向公眾表示歉意。
澳門海關已於2017年7月4日對涉事人員提起紀律調查程序。
澳門海關針對是次事件作進一步檢討內部管理和監督機制，將加強人員培訓，完善內部指令及工作指引，以杜絕同類事件再次發生。
相關程序已於日前完成，兩名涉事的海關人員已被科處罰款。另外，由於在證據搜集方面存在困難，因此未能對其他可能涉事的人員開展調查程序。